一般情况下，水稻需施4次肥，分别是基肥、分蘖肥、穗肥和粒肥。
氮肥可以促进水稻的生长，增强水稻的生长能力。但氮肥过多，容易导致水稻徒长，还会影响水稻转绿，从而引发各种病虫害，出现倒伏、空秕等不良现象。氮肥过多还会降低水稻的结实率，导致产量下降。
农家肥中的营养元素含量较为全面，合理的施用农家肥能可以改良土壤，提高土壤的通透性，增强吸水能力，促进水稻的生长。但在施用时，要保证农家肥充分腐熟。未腐熟的农家肥发酵产生的热量会烧坏水稻，使水稻产生肥害，影响水稻的正常生长。
磷钾肥能提高水稻的生长速度，加强水稻的抗病能力，降低病虫害的发病率，促进叶片进行光合作用，提高叶片的功能期，保证稻粒充实，提高产量。磷钾肥经常与农家肥作为基肥施用。在水稻后期适当追施也能促进稻粒灌浆结实。要注意用量，不能偏施，避免产生肥害，影响水稻的正常生长。