应降低鸭群的饲养密度，及时清理鸭舍及运动场内的粪便、污水，为鸭群提供舒适洁净的养殖环境，保持禽舍干燥卫生，改善通风，降低灰尘，减少氨气含量，定期对禽舍、运动场、用具、设备等进行全面消毒。采用“全进全出”制度，对鸭舍内外进行彻底消毒；免疫接种特制的大肠杆菌疫苗有一定的预防效果。
主要注意饲喂环境要清洁，按时清理粪垢污泥，消毒，饲料不能变质，少投放多次饲喂。
鸭大肠杆菌病的防治方法有疫苗接种及药物投放饲料防治。
一是做好种鸭蛋、孵化器、出雏器的消毒，孵化厅及其用具要经常清洗消毒。二是实行“全进全出”制，加强消毒，育雏室、网床和饲养设备须经彻底清洗、消毒后再用；三是加强管理，密度合理，注意通风换气，勤换垫料，保持舍内清洁、干燥；四是保证饲料营养平衡、合理。
加强饲养科学管理，按时做好消毒制度，提前预防疾病发生。
按环节做好消毒处理，饲养管理过程要加强，防疫程序要科学。